在申请东莞市无证厂房抵押贷款时，首先需要联系当地的银行或金融机构，咨询申请流程和材料要求。一般来说，需要提供房屋的权属证明、建筑结构证明、土地证明、税务证明等相关材料。

除此之外，还需要进行厂房评估，评估师将根据房屋的面积、建造年份、周边环境等因素进行评估，最终出具评估报告。评估报告将是银行核准贷款的重要参考。

经过评估后，如符合条件则可以获得贷款额度，待双方协商确定贷款利率和还款方式后，签订贷款合同并进行抵押登记手续，最终放款。

无证厂房抵押贷款的利率不仅与银行的贷款政策有关，还与房屋的抵押价值和客户信用情况相关。一般来说，房屋抵押价值越高、客户信用状况越良好，贷款利率越低。

确保房屋产权清晰，以免发生产权争议导致无法完成抵押手续。

对于没有经过正规建筑鉴定的无证厂房，评估时需要进行比较严格的审核，确保房屋的安全性和合法性。

了解贷款的相关政策和利率，同时与银行进行充分的沟通与谈判，获得最优惠的贷款利率。

贷款前需要了解自己的还款能力，避免借款超出自己的能力范围，造成还款困难导致房屋被收回。

无证厂房抵押贷款的优点是可以解决房主资金燃眉之急，为企业发展提供了资金保障。同时，对于企业经营出现困难时，无证厂房抵押贷款可作为一项应急措施。

缺点是在抵押过程中，需要提供一系列的证明文件和评估报告，流程较为繁琐，时间和所需成本均较高。同时，如果房主不具备偿还能力，借款将会成为包袱，还会导致抵押物被收回。

慎重选择金融机构，要选择信誉度高、有实力的银行或金融机构。

合理控制贷款额度，不要超出自身的还款能力范围。

了解并严格遵守贷款合同的借款、还款等相关条款。

及时履行还款义务，避免产生逾期违约等不良记录。

在风险可控的情况下，无证厂房抵押贷款仍然是一种可选择的借款方式。但是，在决定是否选择此种借款方式之前，需要进行充分的调查和分析，评估自身的还款能力及风险承受能力，以确保借款的合理性和安全性。同时，也需要遵守相关法律法规和银行的贷款政策，不断提升自身的信用度和还款能力，降低借贷风险。